核桃杂交育种是针对早实、丰产、优质、抗病等育种目标，获得具有双亲优良性状的新品种的一种最有效的育种方法，已成为改良核桃遗传品质、培育优良新品种的重要手段。杂交育种有种内杂交、种间杂交和远缘杂交等三种类型。由于核桃属内各树种的染色体数目相同，均能互相杂交结实，加之核桃属树种资源多，野生类型多，基因资源丰富，因此，种内杂交和种间杂交是改良核桃品种的重要途径。相对其他果树来说，核桃杂交育种比较落后，一直以来，国外主要是美国、法国和匈牙利等三个国家在开展这方面工作，都是采用黑核桃与核桃进行种间杂交。截止2001年，法国和匈牙利共选育了20个晚实核桃新品种，美国选育出10个核桃新品种。

我国核桃的杂交育种工作在20世纪60年代中后期就开始了。辽宁经济林研究所、山东省果树研究所、中国林业科学研究院等科研单位以普通核桃为杂交亲本，先后培育出辽宁1号、辽宁5号、辽宁7号、晋龙1号、北京861等优良品种，这些品种的共同特性是结实早、丰产、品质好、出仁率高等。较早开展属间杂交育种研究的是叶茂富等人，他们用核桃和山核桃、核桃和薄壳山核桃进行核桃的种(属)间杂交，但未获得当代杂种tll。方文亮等采用云南薄壳核桃((J.sigillata Dode)与引进的新疆早实丰产核桃((J.regia L)优株作亲本，进行种间杂交育种，以及铁核桃与铁核桃、夹棉核桃、小核桃、美洲薄壳山核桃进行种内及属间杂交亲和性的试验研究。

种内杂交的平均坐果率为55.31，表现出较强的亲和性;种间杂交的平均坐果率26.20%，低于种内杂交，获得了具有两亲本综合优良性状的早实((2^-3 a开花结果)、丰产(幼果期花枝率27.27%^-72.36%，果枝率20.31 ^59.14%，坐果率44.33 ^-80.77%，与亲本的初盛果期相比，表现出较好的丰产性能)、优质和抗病的杂种植株。经过多年的品种试验，培育出云新7914等新品系5个，已开始在生产中推广应用t}o2}。属间杂交中，漾泡x薄壳山核桃的坐果率为3.08%，其余组合均无坐果，亲和性很小或没有亲和性。范志远等(2005)开展了核桃属种间新组合(三台核桃x新早13号((J.regia`Xinzao No.13'))杂交选育新品种研究。按有性杂交育种程序，经历了亲本选择、杂交、杂种后代培育及杂种优株筛选、杂种优株无性系区域性栽培试验等阶段，选育出3个优良早实核桃新品种，即云新90301、云新90303和云新903061。